58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3093 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 507 aa  979    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3060  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 489 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  25.45 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 499 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  22.65 
 
 		 511 aa  77.4  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  29.6 
 
 		 468 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 583 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.06 
 
 		 488 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  21.36 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  24.25 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  24.1 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  24.1 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  26.07 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  24.86 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  24.86 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  24.86 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 586 aa  57  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 463 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  30.43 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  30.43 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  24.92 
 
 		 507 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.88 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  24.3 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0636  putative flippase  19.51 
 
 		 520 aa  51.2  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.765115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2408  polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 591 aa  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2367  membrane protein for polysaccharide transport  25.26 
 
 		 507 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.09 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  29.73 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  21.73 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  21.58 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3391  polysaccharide biosynthesis protein  19.27 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273655  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  31.25 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 419 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  20.76 
 
 		 509 aa  43.5  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>