174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2082 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2082  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  37.88 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  31.11 
 
 		 135 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  32.03 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  30.43 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 736 aa  72.4  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  27.01 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  34.04 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  30.37 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  31.25 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  32.8 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.93 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.92 
 
 		 926 aa  67.8  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  29.13 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  29.01 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  31.2 
 
 		 681 aa  66.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  28.91 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  34.35 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.37 
 
 		 689 aa  65.1  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 515 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.63 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  25.4 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  30.08 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 779 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  29.23 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  26.98 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3062  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  62  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.841823  hitchhiker  0.00962187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0635  hemerythrin-like metal-binding protein  28.78 
 
 		 143 aa  62  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  26.98 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  31.54 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  29.92 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.87 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  26.52 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  28.24 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 722 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.38 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 		 941 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  25.6 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  28.24 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1887  hemerythrin-like metal-binding protein  25.62 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0840265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  31.4 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1051  hemerythrin-like metal-binding protein  26.92 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  25.41 
 
 		 722 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1699  hemerythrin family non-heme iron protein  28.1 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0136228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  30.23 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  27.07 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  27.64 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  26.52 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  32.82 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  28.35 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.03 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  26.77 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10440  hemerythrin-like metal-binding protein  26.47 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000654042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  25.98 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  31.5 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.93 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0253  hemerythrin  30.08 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  32.8 
 
 		 470 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0610  hemerythrin-like metal-binding protein  34.4 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  23.53 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0183  hemerythrin-like metal-binding protein  26.02 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0618  hemerythrin-like metal-binding protein  31.3 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.8405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0575  hemerythrin-like, metal-binding protein  34.13 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  31.34 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  27.78 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0602  hemerythrin-like metal-binding protein  33.6 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4300  hemerythrin-like metal-binding protein  35.37 
 
 		 134 aa  53.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  31.34 
 
 		 153 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  27.2 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.34 
 
 		 559 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  28.15 
 
 		 144 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2762  diguanylate cyclase with hemerythrin-like metal-binding domain  31.06 
 
 		 631 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  30.43 
 
 		 131 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.24 
 
 		 579 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  24.24 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 145 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3211  hemerythrin HHE cation binding region  29.77 
 
 		 176 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0383  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.04 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  26.72 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  22.5 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  28.57 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  30.33 
 
 		 132 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0411  hemerythrin-like metal-binding protein  33.04 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0412  hemerythrin-like metal-binding protein  33.04 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  28.35 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>