More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1832 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  100 
 
 		 210 aa  428  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  60.11 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 292 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 209 aa  236  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  61.2 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 		 211 aa  235  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  60.66 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  60.66 
 
 		 209 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  60.56 
 
 		 211 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  60.56 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  60.56 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 234 aa  228  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  56.08 
 
 		 205 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 		 212 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  54.84 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 203 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.88 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 		 232 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.36 
 
 		 213 aa  207  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  50.48 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  53.33 
 
 		 190 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  54.89 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  52.06 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 219 aa  201  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  56.22 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  54.7 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  53.11 
 
 		 197 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  54.14 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  47.83 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  50.26 
 
 		 213 aa  197  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  49.28 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  53.04 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 		 229 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  48.08 
 
 		 213 aa  194  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  49.47 
 
 		 190 aa  194  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  54.59 
 
 		 204 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  51.37 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  53.85 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  46.8 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 		 269 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  51.37 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  48.15 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  48.96 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  50.28 
 
 		 204 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 190 aa  187  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  46.11 
 
 		 190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  47.09 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  45.6 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  43.54 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  48.63 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  48.88 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  48.88 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 188 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  48.33 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  49.2 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  47.7 
 
 		 179 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  48.36 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  46.2 
 
 		 235 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  49.16 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  53.26 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  52.87 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  46.52 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  47.78 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  48.02 
 
 		 235 aa  174  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  48.53 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  48.96 
 
 		 257 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 194 aa  174  9e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  49.46 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  48.89 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  45.31 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  51.11 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>