More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0859 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  78.24 
 
 		 223 aa  353  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  77.17 
 
 		 218 aa  353  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  77.42 
 
 		 219 aa  351  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  74.54 
 
 		 226 aa  347  7e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  78.54 
 
 		 216 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  73.27 
 
 		 223 aa  325  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  67.93 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  64.4 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  64.21 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  62.18 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  62.18 
 
 		 239 aa  255  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  61.78 
 
 		 235 aa  254  6e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  62.43 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 		 193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  62.38 
 
 		 235 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  63.28 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  60.73 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  62.77 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  60.2 
 
 		 212 aa  245  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 218 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  64.2 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  64.2 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  60.8 
 
 		 190 aa  242  3e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 		 189 aa  242  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  58.73 
 
 		 199 aa  239  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  61.67 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  60.56 
 
 		 185 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  61.99 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  59.22 
 
 		 190 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 		 195 aa  238  6.999999999999999e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  61.85 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  62.22 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  58.52 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  59.78 
 
 		 190 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 194 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  60.92 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  61.99 
 
 		 186 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  60.92 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  60.92 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 		 190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  58.99 
 
 		 186 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 186 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 		 181 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  57.54 
 
 		 190 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  61.4 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  60.34 
 
 		 181 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  58.62 
 
 		 181 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 186 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 184 aa  227  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  60.82 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  60.82 
 
 		 186 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  58.52 
 
 		 193 aa  226  3e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  56.9 
 
 		 181 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 		 186 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 201 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.34 
 
 		 226 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 188 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  52.34 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  54.75 
 
 		 186 aa  220  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 		 184 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  61.88 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  56.9 
 
 		 179 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  55.61 
 
 		 200 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 		 198 aa  214  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 		 181 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  61.33 
 
 		 217 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  59.77 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  50.78 
 
 		 435 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 192 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  57.38 
 
 		 185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  60.56 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  54.34 
 
 		 184 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  52.22 
 
 		 182 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  54.17 
 
 		 181 aa  209  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  57.92 
 
 		 205 aa  208  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  53.59 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 189 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 188 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  52.91 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 202 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  56.83 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  56.59 
 
 		 188 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  57.46 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>