79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3182 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  85.95 
 
 		 265 aa  330  8e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  77.3 
 
 		 245 aa  300  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  77.3 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  77.3 
 
 		 245 aa  299  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  76.22 
 
 		 259 aa  296  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  76.76 
 
 		 245 aa  294  5e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  64.5 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  65 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  64.5 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  64.5 
 
 		 217 aa  260  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  65.43 
 
 		 259 aa  252  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  60.5 
 
 		 222 aa  247  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  60.32 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  55.5 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  55.79 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  55.79 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  58.2 
 
 		 260 aa  234  6e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  55 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  58.55 
 
 		 232 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  58.03 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  51 
 
 		 217 aa  220  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  51 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  50.5 
 
 		 229 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  52.38 
 
 		 243 aa  218  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  49.73 
 
 		 232 aa  208  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  53.4 
 
 		 227 aa  207  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  52.04 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  52.04 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  52.38 
 
 		 229 aa  204  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3700  hypothetical protein  61.33 
 
 		 114 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  35.42 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  40.15 
 
 		 254 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  33 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  32.68 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  32.98 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.84 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  38.03 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  37.32 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  30.88 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  27.92 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  27.92 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  37.5 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  34.01 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  28.91 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  28.91 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  30.92 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  27.14 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  26.9 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  26.32 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  25.41 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  26.55 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  27.65 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  26.59 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  26.6 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  25.88 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  27.63 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.08 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  26.89 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  24.85 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  26.53 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  28.87 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  24.85 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  26.32 
 
 		 254 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  34.09 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  31.79 
 
 		 340 aa  45.1  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  48.84 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  32.56 
 
 		 259 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  27.47 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.63 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  25.75 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  45.24 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  35.44 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  32.31 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>