More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2956 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_3402  adenylosuccinate lyase  81.94 
 
 		 462 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2720  adenylosuccinate lyase  86.81 
 
 		 457 aa  818    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.382764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2442  adenylosuccinate lyase  81.94 
 
 		 462 aa  783    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2964  adenylosuccinate lyase  87.47 
 
 		 457 aa  815    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.989167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3288  adenylosuccinate lyase  65.93 
 
 		 455 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.650237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2819  adenylosuccinate lyase  94.32 
 
 		 458 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0518  adenylosuccinate lyase  69.89 
 
 		 456 aa  654    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.448433 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0358  adenylosuccinate lyase  81.94 
 
 		 462 aa  783    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3438  adenylosuccinate lyase  82.16 
 
 		 483 aa  772    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1794  adenylosuccinate lyase  75 
 
 		 459 aa  707    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0813752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3752  adenylosuccinate lyase  82.16 
 
 		 482 aa  779    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3624  adenylosuccinate lyase  68.21 
 
 		 457 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.12495  normal  0.263757 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1216  adenylosuccinate lyase  81.94 
 
 		 462 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1511  adenylosuccinate lyase  74.39 
 
 		 483 aa  712    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.411987 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1221  adenylosuccinate lyase  82.6 
 
 		 483 aa  786    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1819  adenylosuccinate lyase  67.47 
 
 		 456 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.558507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0593  adenylosuccinate lyase  80.18 
 
 		 462 aa  769    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2956  adenylosuccinate lyase  100 
 
 		 458 aa  943    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2717  adenylosuccinate lyase  82.38 
 
 		 482 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.882341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0183  adenylosuccinate lyase  82.82 
 
 		 462 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2576  adenylosuccinate lyase  80.62 
 
 		 462 aa  771    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000542791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2554  adenylosuccinate lyase  88.13 
 
 		 457 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.660215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4026  adenylosuccinate lyase  66.38 
 
 		 459 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0561  adenylosuccinate lyase  82.82 
 
 		 462 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3436  adenylosuccinate lyase  82.16 
 
 		 462 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.587084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3366  adenylosuccinate lyase  81.28 
 
 		 462 aa  781    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000111293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3376  adenylosuccinate lyase  66.38 
 
 		 459 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0587  adenylosuccinate lyase  82.6 
 
 		 462 aa  763    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0893212  normal  0.36652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0666  adenylosuccinate lyase  82.82 
 
 		 462 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.600757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2627  adenylosuccinate lyase  81.94 
 
 		 462 aa  784    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0157894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0633  adenylosuccinate lyase  82.82 
 
 		 462 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4669  adenylosuccinate lyase  66.16 
 
 		 459 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5167  adenylosuccinate lyase  65.94 
 
 		 459 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.518617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2578  adenylosuccinate lyase  67.84 
 
 		 456 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.763537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30110  adenylosuccinate lyase  67.84 
 
 		 456 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4662  adenylosuccinate lyase  65.5 
 
 		 459 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163843  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0852  adenylosuccinate lyase  65.07 
 
 		 481 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2402  adenylosuccinate lyase  66.74 
 
 		 456 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.129184  normal  0.0983593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3598  adenylosuccinate lyase  66.3 
 
 		 471 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28380  adenylosuccinate lyase  65.72 
 
 		 462 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4111  adenylosuccinate lyase  67.04 
 
 		 457 aa  621  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3192  adenylosuccinate lyase  65.64 
 
 		 472 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3412  adenylosuccinate lyase  67.32 
 
 		 458 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.507882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3914  adenylosuccinate lyase  64.19 
 
 		 483 aa  617  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0304916  hitchhiker  0.00468958 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0960  adenylosuccinate lyase  64.11 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000552742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4049  adenylosuccinate lyase  63.97 
 
 		 459 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1675  adenylosuccinate lyase  64.1 
 
 		 459 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3621  adenylosuccinate lyase  65.2 
 
 		 472 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3420  adenylosuccinate lyase  65.42 
 
 		 472 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3360  adenylosuccinate lyase  65.64 
 
 		 456 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0546481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4016  adenylosuccinate lyase  65.2 
 
 		 456 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.704284  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1817  adenylosuccinate lyase  65.2 
 
 		 472 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1158  adenylosuccinate lyase  64.19 
 
 		 459 aa  605  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2381  adenylosuccinate lyase  63.22 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1764  adenylosuccinate lyase  63.44 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0961  adenylosuccinate lyase  64.32 
 
 		 457 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118587 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0644  adenylosuccinate lyase  63 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01822  adenylosuccinate lyase  63 
 
 		 478 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2446  adenylosuccinate lyase  63.88 
 
 		 454 aa  598  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.673472  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1146  adenylosuccinate lyase  62.8 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.17359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003857  adenylosuccinate lyase  63.22 
 
 		 456 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.574073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01129  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01137  hypothetical protein  62.33 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2241  adenylosuccinate lyase  63 
 
 		 460 aa  595  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1294  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1592  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1309  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2540  adenylosuccinate lyase  62.86 
 
 		 456 aa  596  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2707  adenylosuccinate lyase  63.31 
 
 		 456 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0624698 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3268  adenylosuccinate lyase  62.78 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1994  adenylosuccinate lyase  62.11 
 
 		 456 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.922086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2472  adenylosuccinate lyase  62.11 
 
 		 456 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1251  adenylosuccinate lyase  62.11 
 
 		 456 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2516  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00611502  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2134  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0323604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02370  adenylosuccinate lyase  61.89 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.718136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1879  adenylosuccinate lyase  62.19 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000162136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01205  adenylosuccinate lyase  62.86 
 
 		 455 aa  589  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1245  adenylosuccinate lyase  61.93 
 
 		 463 aa  591  1e-167  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00902866  normal  0.920871 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2195  adenylosuccinate lyase  62.11 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1333  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887926  normal  0.184863 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1826  adenylosuccinate lyase  61.97 
 
 		 456 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1349  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1952  adenylosuccinate lyase  62.33 
 
 		 456 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2593  adenylosuccinate lyase  61.3 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.138176  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1558  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1311  adenylosuccinate lyase  61.67 
 
 		 456 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.634296  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1065  adenylosuccinate lyase  63.44 
 
 		 458 aa  584  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.403225  normal  0.751482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2064  adenylosuccinate lyase  62.86 
 
 		 456 aa  585  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00558095  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2902  adenylosuccinate lyase  60.35 
 
 		 456 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2635  adenylosuccinate lyase  61.52 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1871  adenylosuccinate lyase  61.07 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0121528  hitchhiker  0.00000377009 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2473  adenylosuccinate lyase  61.07 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00166519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1601  adenylosuccinate lyase  61.74 
 
 		 456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1676  adenylosuccinate lyase  61.52 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.167323  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2262  adenylosuccinate lyase  61.07 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1940  adenylosuccinate lyase  60.79 
 
 		 455 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1644  adenylosuccinate lyase  60.13 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1867  adenylosuccinate lyase  61.73 
 
 		 456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2106  adenylosuccinate lyase  60.71 
 
 		 455 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>