More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0762 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  94.57 
 
 		 258 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 		 266 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 		 262 aa  344  7e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.41 
 
 		 262 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.86 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.76 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 263 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 263 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 273 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.2 
 
 		 258 aa  338  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 262 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 		 272 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.37 
 
 		 263 aa  338  5e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.97 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.98 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.84 
 
 		 269 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.2 
 
 		 294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.37 
 
 		 258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.59 
 
 		 258 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 252 aa  334  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 252 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.15 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 		 265 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 252 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 252 aa  332  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  66.01 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  66.01 
 
 		 252 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 		 256 aa  331  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.01 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 		 256 aa  329  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 		 271 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 		 273 aa  327  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  66.27 
 
 		 273 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.45 
 
 		 271 aa  325  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.4 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 262 aa  325  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 		 257 aa  325  5e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 		 254 aa  322  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 		 262 aa  321  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.99 
 
 		 284 aa  320  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.14 
 
 		 257 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.04 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  64.82 
 
 		 611 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.82 
 
 		 256 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 		 256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.59 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.59 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.96 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  52.02 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  52.02 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  49.8 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  50.81 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  49.16 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  49.58 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  48.78 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  48.78 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  46.15 
 
 		 286 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  49.15 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  49.15 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  43.73 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  47.15 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  47.97 
 
 		 276 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  47.56 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  38.49 
 
 		 310 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.15 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  37.64 
 
 		 593 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  38.49 
 
 		 612 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.16 
 
 		 613 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  37.59 
 
 		 629 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1407  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP-binding protein-like protein  37.55 
 
 		 630 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243275  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.31 
 
 		 464 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.5 
 
 		 617 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  40.97 
 
 		 619 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  36.23 
 
 		 625 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4390  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.59 
 
 		 619 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.394233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  35.71 
 
 		 307 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.2 
 
 		 347 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0962  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000380465 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0214  peptide ABC transporter ATPase  36.43 
 
 		 569 aa  155  8e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.5 
 
 		 626 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.88 
 
 		 454 aa  154  9e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0190299  normal  0.692526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 619 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  38.22 
 
 		 566 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7026  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.64 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>