More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4120 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
258 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  98.45 
 
 
258 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  88.37 
 
 
258 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  87.21 
 
 
258 aa  464  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  81.78 
 
 
258 aa  443  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.25 
 
 
264 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  78.04 
 
 
272 aa  390  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.69 
 
 
266 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.79 
 
 
266 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.86 
 
 
262 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.65 
 
 
263 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.44 
 
 
265 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.87 
 
 
256 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.31 
 
 
257 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 
262 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.65 
 
 
257 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.8 
 
 
257 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.11 
 
 
257 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.24 
 
 
256 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.72 
 
 
284 aa  357  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  67.19 
 
 
273 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 
273 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.08 
 
 
260 aa  351  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.45 
 
 
271 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.06 
 
 
271 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.17 
 
 
251 aa  345  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  67.98 
 
 
252 aa  345  4e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  344  6e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.98 
 
 
252 aa  344  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
262 aa  341  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.88 
 
 
254 aa  339  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.1 
 
 
262 aa  338  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.45 
 
 
262 aa  335  5.999999999999999e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
263 aa  334  7e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
263 aa  334  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.59 
 
 
258 aa  334  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
262 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.02 
 
 
262 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
273 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.75 
 
 
256 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
256 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
256 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.98 
 
 
258 aa  319  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.39 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.39 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.39 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.39 
 
 
256 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.15 
 
 
294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  63.14 
 
 
611 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.99 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.99 
 
 
256 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.08 
 
 
254 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  56.86 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  56.86 
 
 
260 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  44.77 
 
 
276 aa  227  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  49.6 
 
 
283 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  49.6 
 
 
283 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  45.93 
 
 
278 aa  224  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  47.56 
 
 
276 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  47.56 
 
 
276 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  42.7 
 
 
278 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  48.58 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  47.92 
 
 
280 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  48.58 
 
 
276 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  47.08 
 
 
276 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  47.08 
 
 
276 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  48.33 
 
 
276 aa  217  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  47.08 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  43.9 
 
 
286 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 
291 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.84 
 
 
593 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
601 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  38.85 
 
 
593 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  39.17 
 
 
612 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0111  dipeptide transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 
322 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
516 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  38.96 
 
 
298 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  35.8 
 
 
575 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  35.34 
 
 
686 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  35.11 
 
 
617 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  34.59 
 
 
686 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.346759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  37.22 
 
 
310 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
609 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  36.36 
 
 
568 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.84 
 
 
548 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  34.6 
 
 
627 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  39.62 
 
 
539 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.72 
 
 
623 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.56 
 
 
445 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.11 
 
 
643 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14270  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.33 
 
 
577 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
323 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1341  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  37.5 
 
 
349 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>