More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0320 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  99.61 
 
 
611 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.61 
 
 
256 aa  510  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.61 
 
 
256 aa  510  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.61 
 
 
256 aa  510  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  99.22 
 
 
256 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  81.64 
 
 
256 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  82.03 
 
 
256 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  81.25 
 
 
256 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.03 
 
 
271 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.63 
 
 
271 aa  354  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  69.84 
 
 
273 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.05 
 
 
269 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.9 
 
 
273 aa  350  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 
263 aa  340  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
262 aa  337  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.1 
 
 
284 aa  337  9e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.14 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.94 
 
 
257 aa  334  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 
260 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.92 
 
 
258 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.99 
 
 
258 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 
258 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 
256 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 
258 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.67 
 
 
256 aa  325  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 
262 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.03 
 
 
262 aa  324  7e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.64 
 
 
257 aa  324  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.14 
 
 
258 aa  321  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
273 aa  321  6e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
263 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.78 
 
 
251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
262 aa  319  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.45 
 
 
272 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.35 
 
 
257 aa  319  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
252 aa  318  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  64.68 
 
 
252 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
252 aa  318  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
252 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  64.68 
 
 
252 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
252 aa  318  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.85 
 
 
264 aa  318  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
252 aa  318  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.54 
 
 
257 aa  317  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.22 
 
 
262 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
252 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
254 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.24 
 
 
266 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.7 
 
 
265 aa  310  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.66 
 
 
266 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.43 
 
 
258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.45 
 
 
262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.89 
 
 
294 aa  299  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.08 
 
 
260 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.08 
 
 
260 aa  296  2e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.9 
 
 
254 aa  288  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  50.2 
 
 
279 aa  231  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  49.8 
 
 
280 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  46.57 
 
 
276 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  46.57 
 
 
276 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  50.85 
 
 
283 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  50.85 
 
 
283 aa  221  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  49.79 
 
 
276 aa  221  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  48.93 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  48.5 
 
 
276 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  47.35 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  48.07 
 
 
278 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  48.48 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  46.58 
 
 
276 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  46.58 
 
 
276 aa  208  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  42.34 
 
 
286 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
291 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  40.31 
 
 
575 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  39.23 
 
 
593 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  39.84 
 
 
583 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 
326 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.65 
 
 
573 aa  164  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  37.59 
 
 
623 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1252  putative phosphonate C-P lyase system protein PhnK  38.1 
 
 
629 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 
326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  37.69 
 
 
310 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.8 
 
 
568 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.31 
 
 
334 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
623 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0618  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
725 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
619 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1120  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 
350 aa  159  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.667973  decreased coverage  0.00637132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 
340 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>