More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0274 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  87.6 
 
 		 258 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  87.21 
 
 		 258 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  87.98 
 
 		 258 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  85.27 
 
 		 258 aa  461  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.08 
 
 		 266 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.89 
 
 		 272 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.29 
 
 		 264 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  74.8 
 
 		 266 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.81 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.31 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  74.02 
 
 		 257 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.31 
 
 		 257 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  71.94 
 
 		 256 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  74.51 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.08 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.63 
 
 		 257 aa  364  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.2 
 
 		 256 aa  364  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.09 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.84 
 
 		 257 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.96 
 
 		 263 aa  363  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  68.9 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.29 
 
 		 273 aa  361  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.29 
 
 		 269 aa  360  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  68.63 
 
 		 252 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.63 
 
 		 252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.24 
 
 		 252 aa  355  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.5 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.9 
 
 		 271 aa  351  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.5 
 
 		 271 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.45 
 
 		 262 aa  345  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 		 263 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 		 263 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.49 
 
 		 254 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.23 
 
 		 262 aa  343  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 		 273 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.19 
 
 		 262 aa  339  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 		 262 aa  338  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 		 262 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.37 
 
 		 258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.93 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.93 
 
 		 256 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.54 
 
 		 256 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.76 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 		 256 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  64.57 
 
 		 611 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.15 
 
 		 294 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.16 
 
 		 254 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.14 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.14 
 
 		 260 aa  285  5e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  46.4 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  44.48 
 
 		 278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  49.58 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  49.58 
 
 		 276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  50 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  50 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  42.35 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  43.8 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  43.8 
 
 		 276 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  48.96 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  44.93 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  47.03 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  47.03 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  48.13 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  42.45 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.08 
 
 		 593 aa  175  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0678  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 		 445 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106585  normal  0.159459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  41 
 
 		 601 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  40.46 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  39.33 
 
 		 568 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  36.68 
 
 		 575 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2045  ABC transporter-like  36.98 
 
 		 627 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344887  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  39.33 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4790  ABC transporter-like protein protein  35.88 
 
 		 617 aa  161  8.000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.918505  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 		 334 aa  160  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1341  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  37.55 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2496  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 454 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03391  dipeptide transporter  38.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0172  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0175  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3739  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03342  hypothetical protein  38.17 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0938  ABC transporter related  34.08 
 
 		 686 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.96 
 
 		 643 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  38.58 
 
 		 613 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 		 334 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  38.95 
 
 		 613 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0965  ABC transporter related  34.46 
 
 		 686 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.346759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>