More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1312 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
265 aa  527  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.92 
 
 
272 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.15 
 
 
264 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.98 
 
 
266 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  74.42 
 
 
266 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.86 
 
 
257 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.17 
 
 
256 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.73 
 
 
262 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75 
 
 
258 aa  381  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.81 
 
 
258 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.28 
 
 
257 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.02 
 
 
258 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.83 
 
 
258 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  72.44 
 
 
258 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  70.08 
 
 
271 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.93 
 
 
284 aa  344  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.14 
 
 
257 aa  344  8e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.32 
 
 
257 aa  339  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.86 
 
 
262 aa  338  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  69.29 
 
 
271 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.65 
 
 
269 aa  338  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.86 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 
263 aa  335  7e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.61 
 
 
258 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.77 
 
 
260 aa  331  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.5 
 
 
262 aa  331  9e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  65.88 
 
 
273 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.49 
 
 
262 aa  328  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
273 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
263 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
263 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.27 
 
 
262 aa  322  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 
262 aa  321  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
254 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.31 
 
 
273 aa  318  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.35 
 
 
252 aa  316  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
252 aa  314  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.96 
 
 
252 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.71 
 
 
262 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 
251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 
258 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  305  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.1 
 
 
256 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.7 
 
 
256 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  63.1 
 
 
611 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.7 
 
 
256 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.06 
 
 
254 aa  291  7e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.31 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.31 
 
 
260 aa  282  3.0000000000000004e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  50.19 
 
 
279 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  50.19 
 
 
280 aa  246  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  52.7 
 
 
276 aa  236  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  50 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  49.17 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  49.17 
 
 
276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  50.82 
 
 
283 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  50.82 
 
 
283 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  47.5 
 
 
276 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  47.5 
 
 
276 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  47.11 
 
 
278 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  47.11 
 
 
278 aa  225  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  49.39 
 
 
276 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  48.72 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  45.24 
 
 
286 aa  206  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 
291 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0817  ABC transporter related  40 
 
 
285 aa  162  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
593 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  40.43 
 
 
593 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.31 
 
 
611 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0888  ABC transporter related  39.62 
 
 
285 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
601 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  37.93 
 
 
544 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3903  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.6 
 
 
339 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0110  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 
342 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0879  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
436 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0142  dipeptide transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 
329 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1341  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  37.36 
 
 
349 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40.76 
 
 
546 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  35.63 
 
 
623 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3859  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 
334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.712136  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7522  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.06 
 
 
330 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  42.64 
 
 
594 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0348  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 
338 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3991  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.93 
 
 
334 aa  155  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
444 aa  155  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4908  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 
334 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4094  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 
335 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0188  dipeptide transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 
337 aa  155  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0215713  normal  0.434056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4032  dipeptide transporter ATP-binding subunit  37.64 
 
 
334 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>