More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0103 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 241 aa  478  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  40.17 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  40.76 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  46.57 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 242 aa  158  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  41.7 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  43.04 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  39.5 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  40.52 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  46.86 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  40.09 
 
 		 242 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  43.89 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  41.38 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  43.14 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  42.65 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  45.05 
 
 		 242 aa  145  8.000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  45.37 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  46.63 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.12 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.1 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0304  dethiobiotin synthase  35.78 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  34.6 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  39.01 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  45.88 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  41.18 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  30.48 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  34.3 
 
 		 212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0398  dethiobiotin synthase  35.96 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1568  dethiobiotin synthase  41.79 
 
 		 231 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  39.83 
 
 		 234 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  36.27 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.37 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  45.4 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0613  dethiobiotin synthase  45.93 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661073  normal  0.951436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  38.42 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  45.4 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0968  dithiobiotin synthetase  44.93 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1632  normal  0.222848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  31.76 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3426  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2678  dithiobiotin synthetase  35.47 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  46.6 
 
 		 223 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0076  dethiobiotin synthase  45.45 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5739  dethiobiotin synthase  43.98 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.945686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  37.55 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1163  dethiobiotin synthase  40.17 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  29.03 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0070  dethiobiotin synthase  44.98 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  39.79 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  36.32 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  36.32 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  36.32 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  39.52 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0088  dethiobiotin synthase  44.98 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.021607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  37.81 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3699  dethiobiotin synthase  40.1 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0969414  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  35.82 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2753  dithiobiotin synthetase  37.44 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  39.88 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4370  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 225 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.497713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  32.79 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  36.87 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3096  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  37.04 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3453  dethiobiotin synthase  36.45 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  38.24 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  31.55 
 
 		 190 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  34.31 
 
 		 225 aa  101  9e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0003  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  38.6 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  37.21 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0517  dethiobiotin synthase  31.58 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0354098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  34.63 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  38.35 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  38.54 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  38.12 
 
 		 219 aa  99.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  36.05 
 
 		 213 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  34.33 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  34.33 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  28.29 
 
 		 228 aa  99  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  33.83 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  34.64 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5172  dithiobiotin synthetase  35.27 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0206613  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  33.83 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  34.62 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.16 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10780  dethiobiotin synthase  40.29 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  33.83 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  33.83 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>