40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4974 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4974  WGR domain protein  100 
 
 		 81 aa  166  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6815  WGR domain protein  96.3 
 
 		 81 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0486737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6560  WGR domain protein  96.3 
 
 		 81 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8126  hypothetical protein  64.56 
 
 		 102 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4328  WGR  63.29 
 
 		 94 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.153975  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5519  WGR domain protein  56.96 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468487  hitchhiker  0.00260514 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9587  hypothetical protein  58.02 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0128521  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4763  WGR domain-containing protein  62.03 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000263254  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5967  WGR domain-containing protein  55.7 
 
 		 83 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.49925 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7047  hypothetical protein  62.3 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0010  hypothetical protein  54.05 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.0997876 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4030  WGR domain-containing protein  54.17 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3754  WGR domain-containing protein  54.17 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.139809  normal  0.744081 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4670  hypothetical protein  55.71 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.223632  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4211  hypothetical protein  46.84 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.313647 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4085  WGR domain-containing protein  49.32 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144172  normal  0.0339375 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7352  hypothetical protein  51.43 
 
 		 85 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0982555  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4993  WGR domain-containing protein  46.67 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5799  WGR domain-containing protein  51.85 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362732  hitchhiker  0.0021434 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9182  hypothetical protein  48.57 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.7006  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7057  hypothetical protein  48.57 
 
 		 109 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213549  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4161  WGR  47.83 
 
 		 114 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0822744  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1537  WGR  43.66 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3555  WGR domain protein  40.24 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2726  WGR domain protein  37.66 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.267378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3846  hypothetical protein  42.86 
 
 		 74 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3307  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4040  WGR domain-containing protein  40 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0027  WGR  42.03 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3178  WGR domain-containing protein  44.16 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5398  WGR domain-containing protein  40 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.87567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3708  WGR domain-containing protein  32.39 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0084347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3691  WGR domain protein  41.18 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.476572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3916  WGR domain-containing protein  32.84 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3303  hypothetical protein  38.24 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.417751  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0022  hypothetical protein  36.92 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3272  WGR domain-containing protein  36.99 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.705915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0110  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0265  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3021  WGR domain protein  47.62 
 
 		 1314 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0786299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>