287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3002 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  88.81 
 
 		 296 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  63.76 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  53.5 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  53.5 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  59.93 
 
 		 296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  54.55 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.25 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  43.58 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  43.9 
 
 		 323 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  39.52 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  39.15 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  41.43 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  39.59 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  42.35 
 
 		 295 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  42.61 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  41.28 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  41.79 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  39.25 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  41.16 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  41.16 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  41.79 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  41.16 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  37.71 
 
 		 336 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.87 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.65 
 
 		 296 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  41.9 
 
 		 308 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  40.07 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  39.65 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  38.91 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1667  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  39.13 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  39.13 
 
 		 323 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  38.57 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0586  hypothetical protein  35.94 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0483784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.86 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  34.52 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.87 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  31.93 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  31.58 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  31.58 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  31.58 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  31.58 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  31.58 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  30.25 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.53 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  31.82 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  31.93 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  33.69 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.08 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.12 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  32.55 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  30.96 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  32.53 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.76 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.76 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  35.05 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  31.08 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  31.47 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.18 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.08 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  29.18 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  31.01 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.28 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  28.25 
 
 		 305 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  33.09 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  29.21 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  29.72 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.43 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.03 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  31.6 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  28.35 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  26.52 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  31.18 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.2 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  29.59 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>