More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1194 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1194  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.762079  normal  0.0731596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1051  50S ribosomal protein L9  96.88 
 
 		 192 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1516  50S ribosomal protein L9  83.89 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  82.42 
 
 		 191 aa  311  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  66.14 
 
 		 189 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  66.15 
 
 		 189 aa  257  7e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  66.15 
 
 		 189 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  67.39 
 
 		 196 aa  251  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  63.22 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  61.59 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  62.11 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  62.11 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  62.11 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  60.12 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  60.24 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  65.22 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4634  50S ribosomal protein L9  65.19 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269406  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  56.71 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  53.65 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3363  ribosomal protein L9  60.25 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  58.75 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  57.5 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  57.5 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  58.13 
 
 		 209 aa  191  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3812  50S ribosomal protein L9  51.27 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.136797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 195 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2988  50S ribosomal protein L9  53.06 
 
 		 194 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2415  50S ribosomal protein L9  49.75 
 
 		 202 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2461  50S ribosomal protein L9  52.04 
 
 		 196 aa  184  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  56.25 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1694  50S ribosomal protein L9  49.24 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0817246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  53.09 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  52.33 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  52.97 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  53.75 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2293  50S ribosomal protein L9  51.26 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  52.5 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  47.57 
 
 		 199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  49.7 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1902  50S ribosomal protein L9  56.33 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  57.78 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  44.22 
 
 		 149 aa  127  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 149 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  43.48 
 
 		 149 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5226  ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1435  50S ribosomal protein L9  44.93 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0986557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.4 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2196  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 150 aa  111  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0214296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 148 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1329  50S ribosomal protein L9P  43.45 
 
 		 148 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.556068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1529  50S ribosomal protein L9P  42.54 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00288476  normal  0.135454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  37.93 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3034  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 150 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  40.41 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4209  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 150 aa  109  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0984  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  35.86 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4665  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0656931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3348  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 150 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000169987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.14 
 
 		 170 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2566  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3213  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0760  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 150 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.242158  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2249  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 150 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.128176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2383  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 148 aa  107  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4931  50S ribosomal protein L9  40.44 
 
 		 148 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000100703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1821  50S ribosomal protein L9  42.54 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1948  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  39.73 
 
 		 149 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 150 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  34.48 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1231  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.662893  normal  0.0262623 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0914  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  39.46 
 
 		 148 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  43.8 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>