More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3803 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 257 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  95.72 
 
 		 257 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 255 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  62.66 
 
 		 241 aa  305  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  54.31 
 
 		 254 aa  218  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  52.32 
 
 		 254 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  52.32 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 257 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.23 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  47.21 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  48.28 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  44.88 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  42.8 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 248 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  41.3 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 244 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.71 
 
 		 243 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  38.56 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 244 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 255 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  33.91 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  31.45 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  34.4 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>