More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2935 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  82.59 
 
 		 293 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  76.14 
 
 		 286 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  75.19 
 
 		 286 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  75.19 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  73.38 
 
 		 282 aa  407  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  73.64 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  74.13 
 
 		 309 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  72.66 
 
 		 277 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  65.92 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  65.54 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  66.79 
 
 		 282 aa  363  1e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  66.41 
 
 		 283 aa  363  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  62.59 
 
 		 273 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  62.59 
 
 		 273 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  62.59 
 
 		 273 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  62.59 
 
 		 273 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  62.59 
 
 		 273 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  64.15 
 
 		 273 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  62.22 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  62.22 
 
 		 273 aa  351  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  61.85 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  62.22 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  61.57 
 
 		 272 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  61.09 
 
 		 283 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  61.48 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  61.9 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  61.9 
 
 		 277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  63.26 
 
 		 279 aa  341  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  61.63 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  61.87 
 
 		 272 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0888  ABC transporter related  60.92 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00820574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  57.25 
 
 		 270 aa  324  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4536  ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 		 267 aa  321  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2749  ABC transporter related  57.47 
 
 		 270 aa  315  5e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  55.85 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  56.82 
 
 		 270 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0237  ABC transporter related  55.77 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3081  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.81 
 
 		 270 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.216025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2709  ABC transporter related  56.7 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  57.25 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  55.64 
 
 		 269 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4447  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.21 
 
 		 269 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0737  ABC transporter related  56.59 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2223  ABC transporter related  55.04 
 
 		 276 aa  304  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.435588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  55.25 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  52.45 
 
 		 269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  53.58 
 
 		 269 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  52.45 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  52.83 
 
 		 269 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  52.83 
 
 		 269 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0903  hypothetical protein  53.79 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0872  hypothetical protein  53.79 
 
 		 265 aa  298  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  53.31 
 
 		 270 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  53.64 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0561  ABC transporter related  56.54 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2786  ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000312244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0496  ABC transporter related  54.48 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00107814  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0505  toluene tolerance protein Ttg2A  59.46 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002409  ABC transporter ATP-binding protein  58.62 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03186  putative transport protein (ABC superfamily, atp-binding)  55.77 
 
 		 266 aa  293  3e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3610  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.64 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3503  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.64 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.260785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3672  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.64 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0355723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3505  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.64 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3574  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  55.64 
 
 		 270 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2887  ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 269 aa  291  6e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.220334  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0678  ABC transporter related  55.38 
 
 		 272 aa  291  6e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0646516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3370  ABC transporter related  55.13 
 
 		 274 aa  291  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0337  ABC transporter related  53.58 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.425163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0679  ABC transporter related  55 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.962432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3954  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.15 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0158  toluene ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.58 
 
 		 276 aa  290  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2220  ABC transporter related  55.17 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3343  ABC transporter related  55 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03658  hypothetical protein  56.87 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0876  ABC transporter related  50.94 
 
 		 269 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3662  ABC transporter related  54.62 
 
 		 279 aa  288  9e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0392823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0721  ABC transporter related  54.62 
 
 		 272 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0722  ABC transporter related  54.65 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.165434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0713  ABC transporter related  53.56 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0692  ABC transporter related  54.65 
 
 		 277 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3609  ABC transporter related  53.96 
 
 		 270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0733  ABC transporter-related protein  53.21 
 
 		 267 aa  285  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.329181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2102  ABC transporter, ATP-binding protein  56.32 
 
 		 267 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1190  ATP-binding ABC transporter protein  52.29 
 
 		 281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726252  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0512  ABC transporter related protein  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.648269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3388  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0514753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3575  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3491  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3683  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00651992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4517  putative ABC transporter ATP-binding protein YrbF  53.61 
 
 		 269 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.257918  normal  0.710569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>