171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2024 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  100 
 
 
499 aa  1007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  60.48 
 
 
505 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  47.31 
 
 
511 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  47.29 
 
 
512 aa  320  2e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  47.29 
 
 
512 aa  316  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  34.1 
 
 
487 aa  201  4e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.94 
 
 
511 aa  186  1e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  29.92 
 
 
519 aa  178  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  31.63 
 
 
490 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  32.73 
 
 
512 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.47 
 
 
512 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.21 
 
 
512 aa  161  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
505 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  35.01 
 
 
508 aa  148  2e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.72 
 
 
511 aa  149  2e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  29.9 
 
 
508 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.74 
 
 
508 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  31.55 
 
 
494 aa  142  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  30.16 
 
 
513 aa  141  2e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  29.44 
 
 
514 aa  140  5e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  31.91 
 
 
540 aa  140  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  29.5 
 
 
508 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  31.03 
 
 
510 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  30.12 
 
 
596 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  28.69 
 
 
510 aa  132  2e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  28.46 
 
 
543 aa  131  2e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  29.75 
 
 
489 aa  128  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  29.75 
 
 
489 aa  128  2e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  41.97 
 
 
291 aa  129  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  38.79 
 
 
495 aa  119  1e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  4.45512e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  37.68 
 
 
433 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  37.68 
 
 
433 aa  116  1e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  36.53 
 
 
433 aa  116  1e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.01225e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  37.68 
 
 
433 aa  115  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  31.9 
 
 
509 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3587  adenylate cyclase  39.63 
 
 
215 aa  114  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3579  adenylate cyclase  39.63 
 
 
215 aa  114  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0529  putative adenylate cyclase  40.37 
 
 
213 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0648  putative adenylate cyclase  40.37 
 
 
213 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0944  putative adenylate cyclase  40.37 
 
 
213 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  37.68 
 
 
433 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1914  putative adenylate cyclase  40.37 
 
 
213 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  38.73 
 
 
505 aa  114  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  38.57 
 
 
445 aa  113  7e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  37.2 
 
 
433 aa  113  7e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3560  adenylate cyclase  40.64 
 
 
213 aa  113  8e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.567904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  36.07 
 
 
433 aa  113  8e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2913  adenylate cyclase  39.55 
 
 
213 aa  112  1e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  33 
 
 
433 aa  113  1e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2702  adenylate cyclase  38.21 
 
 
211 aa  112  2e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.722773  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  30.42 
 
 
502 aa  112  2e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  37.32 
 
 
505 aa  110  4e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3565  adenylate cyclase  37.67 
 
 
443 aa  110  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00255763  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  29.75 
 
 
498 aa  110  8e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2763  adenylate cyclase  39.55 
 
 
219 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  27.66 
 
 
519 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  37.17 
 
 
286 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  33.43 
 
 
512 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  27 
 
 
504 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  34.13 
 
 
508 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  33.8 
 
 
498 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  30.17 
 
 
510 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  33.22 
 
 
494 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  34.13 
 
 
508 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.79 
 
 
508 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  33.91 
 
 
503 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  35.61 
 
 
321 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  36.28 
 
 
529 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  36.12 
 
 
495 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  33 
 
 
503 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  33.73 
 
 
508 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  33.33 
 
 
503 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  38.81 
 
 
454 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  32.56 
 
 
503 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  28.32 
 
 
520 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0832  adenylate cyclase  33.63 
 
 
443 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.944566  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  36.1 
 
 
321 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  34.26 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3457  adenylate cyclase  36.02 
 
 
433 aa  98.6  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00582228  normal  0.325221 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  37.5 
 
 
500 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  1.93925e-08 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  27.01 
 
 
494 aa  96.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3500  adenylate cyclase  34.29 
 
 
208 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0457  CyaB/UgiF-like adenylyl cyclase  35.05 
 
 
208 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  33.98 
 
 
347 aa  95.5  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2575  adenylate cyclase  36.32 
 
 
208 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0502  adenylate cyclase  36.32 
 
 
208 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0530  adenylate cyclase  36.32 
 
 
208 aa  94.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3182  adenylate cyclase  39.66 
 
 
207 aa  94.7  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  32.64 
 
 
535 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  34.62 
 
 
500 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  5.03049e-08 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  32.74 
 
 
588 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  32.5 
 
 
545 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  34.13 
 
 
495 aa  93.2  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  33.98 
 
 
435 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>