More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1629 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1339  ribonuclease PH  82.3 
 
 		 243 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4325  ribonuclease PH  79.84 
 
 		 243 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2705  tRNA nucleotidyltransferase  80.17 
 
 		 241 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0858  ribonuclease PH  77.41 
 
 		 244 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0923  ribonuclease PH  76.57 
 
 		 244 aa  381  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0705  ribonuclease PH  78.79 
 
 		 241 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3579  ribonuclease PH  74.06 
 
 		 253 aa  362  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.335877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  72.46 
 
 		 238 aa  358  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2477  ribonuclease PH  73.31 
 
 		 239 aa  358  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.804398  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 238 aa  357  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  71.85 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0852  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  72.03 
 
 		 238 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1080  ribonuclease PH  72.08 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0813  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2098  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3051  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3017  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2646  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1966  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211424  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2951  ribonuclease PH  72.88 
 
 		 243 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.304043  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  74.14 
 
 		 246 aa  353  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  71.01 
 
 		 246 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1584  ribonuclease PH  72.77 
 
 		 243 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  73.28 
 
 		 246 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  73.28 
 
 		 246 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  70.59 
 
 		 246 aa  350  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4105  ribonuclease PH  72.84 
 
 		 243 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  73.28 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  73.28 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  73.28 
 
 		 246 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3851  ribonuclease PH  67.8 
 
 		 238 aa  327  8e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.92407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0043  ribonuclease PH  68.64 
 
 		 238 aa  327  8e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0477  RNAse PH  67.53 
 
 		 244 aa  323  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02369  ribonuclease PH  66.67 
 
 		 241 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  64.41 
 
 		 238 aa  318  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  64.46 
 
 		 243 aa  318  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3270  ribonuclease PH  65.96 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2191  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  316  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.184109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2154  ribonuclease PH  62.71 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2589  ribonuclease PH  63.45 
 
 		 238 aa  309  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.704715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0207  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 238 aa  308  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  65.09 
 
 		 247 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  65.11 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  65.11 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04048  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3965  ribonuclease PH  65.25 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0503837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3070  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000996913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  62.98 
 
 		 239 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4014  ribonuclease PH  65.55 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4060  ribonuclease PH  65.55 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.944116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3951  ribonuclease PH  65.55 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1204  ribonuclease PH  62.45 
 
 		 239 aa  304  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0276527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4121  ribonuclease PH  65.55 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.790075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3933  ribonuclease PH  65.55 
 
 		 238 aa  304  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310122  hitchhiker  0.0000391387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 238 aa  304  9.000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4024  ribonuclease PH  68.67 
 
 		 243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  62.55 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3844  ribonuclease PH  63.98 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2960  ribonuclease PH  60.59 
 
 		 239 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.552332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 240 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0973  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 238 aa  301  5.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 240 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001827  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 238 aa  300  9e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0308379  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00648  ribonuclease PH  62.18 
 
 		 240 aa  300  9e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  58.62 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4144  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00364124  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  61.44 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4068  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.010474  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5013  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3978  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.055913  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03500  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0681369  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0062  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  299  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  61.86 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0068  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  hitchhiker  0.000000182868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2035  ribonuclease PH  61.18 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3852  ribonuclease PH  64.71 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0309904  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1292  ribonuclease PH  63.56 
 
 		 238 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0523013  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0453  tRNA nucleotidyltransferase  61.04 
 
 		 239 aa  299  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4106  ribonuclease PH  65.13 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0374298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0096  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.50257  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  61.02 
 
 		 243 aa  298  5e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2343  ribonuclease PH  63.95 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1977  ribonuclease PH  63.95 
 
 		 242 aa  297  9e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.87042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  59.83 
 
 		 239 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  60.17 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3488  ribonuclease PH  63.14 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4282  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  62.87 
 
 		 256 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  59.92 
 
 		 263 aa  295  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  62.29 
 
 		 246 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4395  ribonuclease PH  65.13 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00847728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0153  ribonuclease PH  64.29 
 
 		 238 aa  295  5e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  59.75 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  60.85 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03452  hypothetical protein  65.22 
 
 		 230 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>