214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5838 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5838  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.358125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  56.7 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.91 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.91 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.02 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.26 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.09 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  48 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.98 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.93 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.04 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  44 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  45.26 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  44.2 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.35 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  46.19 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  42.15 
 
 		 344 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0821  hypothetical protein  41.74 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0045  hypothetical protein  42.79 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2194  hypothetical protein  42.79 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  42.79 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  42.79 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2513  hypothetical protein  42.79 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2891  hypothetical protein  42.36 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  40.43 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  39.92 
 
 		 258 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 340 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  40.25 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.6 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.05 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  38.05 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 		 234 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5606  cyclic nucleotide-binding protein  36.73 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36 
 
 		 279 aa  149  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0678  transcriptional regulator-related protein  37.02 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4390  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0044  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2890  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2195  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0643  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0657  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2512  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.315481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0789  cyclic nucleotide-binding  36.8 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.424436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.04 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.62 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  37.5 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  36.4 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  34.26 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1356  hypothetical protein  34.67 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.073199  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5843  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.91 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.918646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2958  cyclic nucleotide-binding  37.27 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.369311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>