28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5441 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5441  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 334 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0626  uroporphyrinogen decarboxylase  36.89 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464405  normal  0.107991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2260  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  36.5 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000313707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0866  uroporphyrinogen decarboxylase  37.46 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3790  hypothetical protein  27.68 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  22.54 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0135  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.05 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.91 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.95 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  20.29 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  21.41 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  23.7 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  21.73 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.76 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2358  hypothetical protein  21.69 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2989  uroporphyrinogen decarboxylase  26.55 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  22.67 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  21.69 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  25.69 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  21.29 
 
 		 363 aa  47  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  21.03 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  28.9 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  28.57 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.87 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  21.88 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.41 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  20.58 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  28.18 
 
 		 359 aa  42.7  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>