More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2745 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  71.17 
 
 
1267 aa  1808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2760  glycosyl transferase group 1  47.55 
 
 
1039 aa  776    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1267 aa  2569    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  52.63 
 
 
337 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0373  hexosyltransferase  37.86 
 
 
389 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1582  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 
394 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0375  hexosyltransferase  33.07 
 
 
390 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2693  glycosyl transferase group 1  38.22 
 
 
421 aa  204  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1230  glycosyl transferase, group 1  38.42 
 
 
413 aa  199  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
401 aa  178  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
303 aa  156  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
300 aa  153  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  39.75 
 
 
616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  36.48 
 
 
302 aa  145  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 
305 aa  140  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  36.14 
 
 
298 aa  138  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
624 aa  136  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
679 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  33.1 
 
 
291 aa  128  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
279 aa  128  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  35.84 
 
 
1340 aa  127  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
346 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  35.27 
 
 
320 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 
318 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
841 aa  121  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
1739 aa  121  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
525 aa  121  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
703 aa  121  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
822 aa  120  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.74 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
994 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
303 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
286 aa  115  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
366 aa  115  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
340 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  34.22 
 
 
330 aa  112  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
282 aa  112  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
341 aa  111  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  37.21 
 
 
632 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
836 aa  111  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
291 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
331 aa  110  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
313 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
294 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.79 
 
 
700 aa  109  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
346 aa  108  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
880 aa  108  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  32.88 
 
 
838 aa  108  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
310 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
293 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.92 
 
 
338 aa  107  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
290 aa  107  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.98 
 
 
2401 aa  106  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  29.49 
 
 
860 aa  106  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
330 aa  106  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
318 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
635 aa  105  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
1106 aa  104  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
308 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
617 aa  104  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
306 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 
334 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
298 aa  103  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
683 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
311 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
722 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
306 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
322 aa  102  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
691 aa  102  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
319 aa  102  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
297 aa  101  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
892 aa  101  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
308 aa  101  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 
310 aa  101  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
300 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
1523 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 
1523 aa  100  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
1152 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
288 aa  100  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
705 aa  100  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
557 aa  99.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
360 aa  99.4  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
324 aa  99  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  36.45 
 
 
691 aa  98.6  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
327 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
691 aa  99  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  33.19 
 
 
284 aa  98.6  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
729 aa  98.2  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
317 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
670 aa  97.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
325 aa  97.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
824 aa  97.4  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
299 aa  98.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  28.12 
 
 
342 aa  97.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  33.49 
 
 
1837 aa  97.1  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
489 aa  97.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
340 aa  97.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
1077 aa  97.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>