More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2509 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  100 
 
 
315 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  88.25 
 
 
315 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  71.11 
 
 
315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.52 
 
 
315 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  54.9 
 
 
353 aa  358  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  57.65 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  57.65 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  57.65 
 
 
329 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  57 
 
 
320 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.27 
 
 
326 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.9 
 
 
342 aa  344  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  56.03 
 
 
336 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  55.95 
 
 
358 aa  341  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  54.4 
 
 
327 aa  338  7e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.07 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  55.7 
 
 
320 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  54.25 
 
 
346 aa  328  7e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.96 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.4 
 
 
327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  54.58 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.72 
 
 
320 aa  326  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  50.16 
 
 
316 aa  326  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  56.35 
 
 
340 aa  326  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
318 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.42 
 
 
332 aa  324  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.3 
 
 
354 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.94 
 
 
318 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  50.65 
 
 
340 aa  322  5e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  49.02 
 
 
326 aa  315  7e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  51.13 
 
 
332 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  50.49 
 
 
340 aa  315  9e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  47.91 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.12 
 
 
329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  53.42 
 
 
351 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.5 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.21 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  48.71 
 
 
349 aa  300  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  48.71 
 
 
346 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  48.61 
 
 
331 aa  300  3e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  51.44 
 
 
320 aa  299  5e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.04 
 
 
326 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  46.77 
 
 
325 aa  296  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.21 
 
 
319 aa  296  3e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47 
 
 
328 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  47.42 
 
 
335 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  45.81 
 
 
318 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  48.89 
 
 
325 aa  293  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  48.39 
 
 
347 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  48.39 
 
 
333 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  47.59 
 
 
318 aa  292  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.47 
 
 
325 aa  291  7e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 
325 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  51.17 
 
 
323 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.89 
 
 
331 aa  290  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  48.55 
 
 
337 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.09 
 
 
333 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  46.95 
 
 
327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  47.48 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  46.58 
 
 
328 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.87 
 
 
331 aa  287  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 
342 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
317 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.1 
 
 
319 aa  287  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.88 
 
 
328 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  49.19 
 
 
316 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.82 
 
 
316 aa  286  4e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  47.6 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  46.46 
 
 
344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  44.95 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.26 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  48.23 
 
 
332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 
332 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3577  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.76 
 
 
321 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.274374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.92 
 
 
347 aa  281  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  46.13 
 
 
339 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  42.54 
 
 
315 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.03 
 
 
324 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  46.95 
 
 
345 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  45.48 
 
 
337 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.25 
 
 
327 aa  278  8e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 
324 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.27 
 
 
329 aa  278  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.11 
 
 
350 aa  278  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  46.31 
 
 
310 aa  277  2e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.02 
 
 
332 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.55 
 
 
330 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  43.81 
 
 
340 aa  275  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.25 
 
 
342 aa  275  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.89 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2374  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.905067  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.74 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  44.84 
 
 
340 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.13 
 
 
315 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  45.31 
 
 
312 aa  273  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 
332 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3184  ATPase  50.17 
 
 
318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.78 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>