38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1309 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1505  hypothetical protein  51.12 
 
 		 383 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2477  protein of unknown function DUF955  50.55 
 
 		 384 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.204932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2482  protein of unknown function DUF955  50.56 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1409  protein of unknown function DUF955  44.03 
 
 		 383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  42 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03130  predicted Zn peptidase  39.33 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0275  DNA-binding protein  37.9 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3252  hypothetical protein  38.91 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6169  protein of unknown function DUF955  31.8 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0537  hypothetical protein  31.58 
 
 		 419 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2518  protein of unknown function DUF955  28.68 
 
 		 378 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.010681 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1747  protein of unknown function DUF955  24.79 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124074  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  26.64 
 
 		 392 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5883  protein of unknown function DUF955  29.43 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3885  hypothetical protein  31.66 
 
 		 375 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0992506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2792  protein of unknown function DUF955  29.34 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1822  hypothetical protein  33.64 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0401473  normal  0.904064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  28.81 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  27.68 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3906  hypothetical protein  27.21 
 
 		 382 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12537  hypothetical protein  27.22 
 
 		 415 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.9395e-37  hitchhiker  0.00258051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2541  protein of unknown function DUF955  45.33 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.24198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  28.68 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  26.52 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  26.18 
 
 		 355 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  23.31 
 
 		 362 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.02 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  29.69 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  29.69 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.77 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  32.08 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  25.99 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  30.83 
 
 		 175 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  26.56 
 
 		 378 aa  42.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>