35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0752 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 634 aa  1277    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  65.63 
 
 		 620 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  32.55 
 
 		 476 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 492 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  49.32 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  47.37 
 
 		 299 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  43.04 
 
 		 185 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  45.71 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  44.29 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  28.91 
 
 		 336 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 593 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  36.9 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 		 389 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 464 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  47.44 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  38.16 
 
 		 87 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  28.78 
 
 		 285 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  39.39 
 
 		 379 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  39.44 
 
 		 171 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  37.88 
 
 		 319 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  35.71 
 
 		 241 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  31.67 
 
 		 287 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 451 aa  50.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  33.8 
 
 		 377 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  30 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 566 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 149 aa  45.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2759  hypothetical protein  29.71 
 
 		 165 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>