32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1614 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
389 aa  766    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  43.81 
 
 
593 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  51.43 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  46.05 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 
464 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
620 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  53.33 
 
 
178 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  44.87 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  47.3 
 
 
185 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  43.06 
 
 
476 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  39.22 
 
 
378 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  42.25 
 
 
437 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  41.89 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  46.58 
 
 
171 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  34.94 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
435 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  36.14 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  36.36 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  44 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  36.09 
 
 
226 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  39.29 
 
 
285 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
492 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  33.33 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  40.51 
 
 
634 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
878 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.18 
 
 
810 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 
632 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  38.71 
 
 
241 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  39.19 
 
 
87 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>