26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0235 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  740    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  75.39 
 
 		 377 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  39.95 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  56.94 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  56.63 
 
 		 615 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  50.67 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  55.26 
 
 		 593 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  44 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  33.99 
 
 		 178 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  49.28 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  43.14 
 
 		 185 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  38.75 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  44.16 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  43.24 
 
 		 171 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  42.59 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  38.89 
 
 		 241 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  34.18 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  42 
 
 		 226 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  39.51 
 
 		 87 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 		 482 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>