28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1257 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
464 aa  911    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  41.11 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  43.78 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  36.31 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  43.24 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0658  hypothetical protein  30.43 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
593 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
615 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 
620 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  27.89 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  35.4 
 
 
185 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  36.49 
 
 
299 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  32.61 
 
 
336 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
464 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  44.12 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0533  hypothetical protein  31.36 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  36.26 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
334 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  41.18 
 
 
378 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
351 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 
492 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  38.89 
 
 
226 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  38.89 
 
 
87 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  33.66 
 
 
160 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  30.26 
 
 
379 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>