36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3831 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 464 aa  926    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  69.33 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 492 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 634 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 620 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  56.94 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  48.31 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  55.56 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  54.43 
 
 		 178 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  45.28 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  53.85 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  45.88 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  50.68 
 
 		 299 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 		 615 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  46.48 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  39.36 
 
 		 241 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  27.46 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  42.5 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  60.47 
 
 		 87 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  40.85 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  40.3 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  36.96 
 
 		 160 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  31.75 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  39.24 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  27.52 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 566 aa  43.9  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  30.11 
 
 		 516 aa  43.5  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 836 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>