29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1166 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
334 aa  676    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 
351 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  36.11 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  35.87 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  46.74 
 
 
620 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  41.58 
 
 
593 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  49.32 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  48.65 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  48 
 
 
615 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  39.29 
 
 
185 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  39.45 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  48.21 
 
 
634 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  32.67 
 
 
336 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  45.21 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  50.79 
 
 
319 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  38.71 
 
 
226 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
389 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  37.66 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  36.36 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  45.71 
 
 
171 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
435 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
437 aa  52.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 
464 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  37.63 
 
 
160 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  44.19 
 
 
87 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
482 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  36.14 
 
 
287 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  34.48 
 
 
379 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>