28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2624 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  41.25 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  33.73 
 
 
377 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  40.26 
 
 
299 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
593 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  32.93 
 
 
160 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  42.47 
 
 
287 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  39.47 
 
 
615 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  33.07 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  30.22 
 
 
241 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2856  hypothetical protein  31.76 
 
 
560 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  40.51 
 
 
171 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
620 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3881  hypothetical protein  35.62 
 
 
285 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0120157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  35.06 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  32.97 
 
 
185 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  34.25 
 
 
319 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0964  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0470419  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  36.84 
 
 
87 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 
476 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
634 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
334 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
464 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>