30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0657 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 435 aa  840    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  77.93 
 
 		 437 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  48.23 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 482 aa  94  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  40.37 
 
 		 593 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  35.4 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  35.38 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  38 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  27.01 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  37.97 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 		 620 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  40.85 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  37.38 
 
 		 185 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  42.11 
 
 		 171 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  39.39 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  33.66 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 334 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  28.71 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  35.62 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0533  hypothetical protein  38.33 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  54.05 
 
 		 87 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0658  hypothetical protein  40 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  43.28 
 
 		 341 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>