30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1314 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  83.24 
 
 		 178 aa  310  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  37.36 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  56.34 
 
 		 492 aa  84.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  57.75 
 
 		 464 aa  84.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  44.55 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  56.34 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  60.76 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 		 620 aa  76.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 615 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  43.3 
 
 		 377 aa  68.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  43.14 
 
 		 378 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  33.56 
 
 		 351 aa  64.7  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  37.68 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  46.48 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  43.04 
 
 		 634 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  26.35 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  44.12 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  38.96 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 437 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 435 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 464 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  28.66 
 
 		 377 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 482 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2624  hypothetical protein  32.97 
 
 		 379 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000177581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  36.54 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 634 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0004  hypothetical protein  27.04 
 
 		 287 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.971077  hitchhiker  0.000830744 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>