27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0306 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0306  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  741    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.0905518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0235  hypothetical protein  75.39 
 
 
378 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1393  TPR repeat-containing protein  40.32 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1166  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
334 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0738188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  56.52 
 
 
615 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3831  TPR repeat-containing protein  57.14 
 
 
464 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.948329 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  56.58 
 
 
593 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1951  TPR repeat-containing protein  52.05 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4409  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 
620 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1314  hypothetical protein  43.3 
 
 
185 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4082  TPR repeat-containing protein  44 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0181  hypothetical protein  49.28 
 
 
299 aa  67  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.189752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1639  hypothetical protein  46.05 
 
 
178 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0764738  hitchhiker  0.00145083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1614  TPR repeat-containing protein  44.87 
 
 
389 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2627  hypothetical protein  49.21 
 
 
319 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000512231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4623  hypothetical protein  36.99 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2964  hypothetical protein  45.33 
 
 
171 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000129712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0752  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
634 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100728  normal  0.0772992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0182  hypothetical protein  46.3 
 
 
226 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1257  TPR repeat-containing protein  44.62 
 
 
464 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0690  hypothetical protein  38.89 
 
 
241 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0044  hypothetical protein  31.68 
 
 
377 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.314723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0534  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 
437 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2840  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0657  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1125  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0005  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
482 aa  46.2  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>