30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3252 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  100 
 
 		 132 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  86.36 
 
 		 132 aa  234  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  83.21 
 
 		 132 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  81.82 
 
 		 132 aa  226  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  46.88 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  47.01 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  33.82 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  37.12 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  30.61 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  35.34 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  30.5 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  30.88 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  32.35 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  28.26 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0390  hypothetical protein  35.8 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  30.19 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  32.71 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  28.47 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  26.43 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  26.43 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0125  hypothetical protein  33.77 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  35.82 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  25.17 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  27.43 
 
 		 118 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>