More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1986 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
337 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  88.22 
 
 
398 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  83.69 
 
 
332 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  75.6 
 
 
399 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  71.9 
 
 
331 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  77.64 
 
 
330 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  74.09 
 
 
332 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.74 
 
 
345 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.67 
 
 
351 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.37 
 
 
353 aa  350  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.92 
 
 
351 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.17 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.47 
 
 
334 aa  335  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.73 
 
 
337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.58 
 
 
353 aa  325  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.39 
 
 
355 aa  323  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.62 
 
 
339 aa  322  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.81 
 
 
346 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
331 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
331 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.31 
 
 
331 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.11 
 
 
339 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.97 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.66 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.66 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.73 
 
 
346 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.34 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.96 
 
 
341 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.82 
 
 
322 aa  299  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.21 
 
 
341 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.72 
 
 
326 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.11 
 
 
346 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.28 
 
 
325 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.35 
 
 
341 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.81 
 
 
329 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.47 
 
 
327 aa  279  5e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.58 
 
 
329 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.45 
 
 
331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.6 
 
 
314 aa  271  2e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.7 
 
 
313 aa  266  5e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.2 
 
 
338 aa  262  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.49 
 
 
297 aa  261  1e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 
333 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.04 
 
 
313 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.15 
 
 
297 aa  256  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.35 
 
 
303 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.08 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
301 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.85 
 
 
337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  50.64 
 
 
311 aa  250  2e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.06 
 
 
311 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.83 
 
 
308 aa  248  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.3 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.13 
 
 
313 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
347 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.52 
 
 
308 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.08 
 
 
312 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.8 
 
 
318 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  46.82 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.44 
 
 
312 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.06 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.06 
 
 
312 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.06 
 
 
317 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
319 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  40.72 
 
 
349 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
321 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.37 
 
 
520 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.83 
 
 
313 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.14 
 
 
307 aa  239  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.42 
 
 
349 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.21 
 
 
349 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.1 
 
 
320 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.45 
 
 
313 aa  238  9e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.95 
 
 
313 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.74 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
313 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.74 
 
 
313 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.91 
 
 
323 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.96 
 
 
313 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.16 
 
 
319 aa  236  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.1 
 
 
317 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.41 
 
 
313 aa  236  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.28 
 
 
314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.42 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47 
 
 
316 aa  236  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>