More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0111 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  100 
 
 
311 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  66.67 
 
 
311 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.73 
 
 
308 aa  362  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.53 
 
 
321 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2502  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.98 
 
 
316 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3527  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.87 
 
 
311 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.17 
 
 
315 aa  331  8e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
317 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
317 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3558  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.88 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.21 
 
 
314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3224  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2559  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3553  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3478  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.77 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000297627  hitchhiker  0.00686608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.1 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3533  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1339  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.42 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0137  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000516622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0129  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03266  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.55 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00192279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.81 
 
 
319 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0640  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.21 
 
 
313 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0753  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.54 
 
 
313 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.88 
 
 
314 aa  322  4e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0628  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.58 
 
 
313 aa  322  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813958  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.99 
 
 
313 aa  322  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2732  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.81 
 
 
319 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3097  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.48 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0522  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3526  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.88 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2926  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.19 
 
 
320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0551  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.56 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.02 
 
 
313 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0480  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.84 
 
 
313 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.64263  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.6 
 
 
313 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.24 
 
 
325 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0069  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.23 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0455  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.84 
 
 
313 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.410064  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.07 
 
 
314 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.05 
 
 
313 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0346  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.92 
 
 
313 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.859571  normal  0.194945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0378  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.25 
 
 
313 aa  314  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.843738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.72 
 
 
313 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.91 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0205  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.42 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3578  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3461  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.55 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.151811 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4227  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00894  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.97 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1991  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.09 
 
 
307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.29 
 
 
314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3812  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.25 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0405  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604669 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0419  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000814721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0393  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0394  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.92 
 
 
313 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1987  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.94 
 
 
316 aa  311  6.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.9 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.916249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4541  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.25 
 
 
313 aa  311  9e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3678  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.93 
 
 
308 aa  311  1e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990517  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0911  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.82 
 
 
307 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.4 
 
 
315 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.75 
 
 
315 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2198  methyltransferase  57.05 
 
 
331 aa  310  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2988  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.61 
 
 
308 aa  310  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.6 
 
 
314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2460  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.77 
 
 
319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2652  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.97 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.75 
 
 
315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.42 
 
 
315 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.13 
 
 
318 aa  308  9e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4473  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.13 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0840  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4110  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.07 
 
 
313 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0936286  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4416  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.42 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0799414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0350  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.36 
 
 
319 aa  305  8.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004498  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50 
 
 
316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2201  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.82 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379608  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3819  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.6 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4681  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.42 
 
 
315 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0572625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.51 
 
 
312 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3425  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.09 
 
 
306 aa  302  5.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37236  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>