29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0065 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0065  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1317  hypothetical protein  47.27 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306144  normal  0.351032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2740  protein of unknown function DUF1622  47.57 
 
 		 300 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0901  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2808  protein of unknown function DUF1622  40.57 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.500646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0408  protein of unknown function DUF1622  58.57 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0949  protein of unknown function DUF1622  60.29 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229976  normal  0.502302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2337  hypothetical protein  39.25 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1563  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0144  hypothetical protein  44.32 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2465  hypothetical protein  38.89 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1082  protein of unknown function DUF1622  44.59 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1404  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2412  hypothetical protein  33.98 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.45762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1490  hypothetical protein  31.3 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3393  protein of unknown function DUF1622  48.78 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000491801  hitchhiker  0.00000738542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4911  protein of unknown function DUF1622  39.13 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2563  hypothetical protein  33.98 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0394513  decreased coverage  0.00000227109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1296  hypothetical protein  35.19 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1187  hypothetical protein  35.35 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2424  hypothetical protein  29 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.67568  normal  0.0636828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3972  hypothetical protein  28 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1730  protein of unknown function DUF1622  51.79 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4026  protein of unknown function DUF1622  34.19 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4064  protein of unknown function DUF1622  34.19 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00544086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1328  hypothetical protein  29.81 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0493  hypothetical protein  30.48 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0701245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2332  hypothetical protein  27.62 
 
 		 110 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2954  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>