98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3955 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  94.76 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  86.19 
 
 		 210 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  97.49 
 
 		 199 aa  333  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  71.43 
 
 		 211 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  70.48 
 
 		 210 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  69.52 
 
 		 210 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  66.99 
 
 		 212 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  67.86 
 
 		 200 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  63.81 
 
 		 210 aa  258  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  62.81 
 
 		 199 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  46.08 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  45.88 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  40.38 
 
 		 207 aa  158  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  45.73 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  45.23 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  46.23 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  38.42 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  33.01 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  34.01 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  34.01 
 
 		 242 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  36.84 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  34.62 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  35.1 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  35.61 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  30.62 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  37.82 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  30.89 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  36.41 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  34.69 
 
 		 231 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  35.68 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  34.54 
 
 		 214 aa  89.4  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.92 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.38 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  30.57 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  29.26 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.93 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  34.87 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  34.18 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  33.88 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  32.67 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  32.04 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  30.46 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  32.98 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  34.18 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  26.82 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.86 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  28.19 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  24.87 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  25 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  32.12 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  25.57 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  32.11 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  24.34 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  28.73 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  28.73 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  24.39 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  28.18 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  25.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  29.05 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  28.49 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.86 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  31.05 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  32.12 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25.26 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  30.45 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  29.74 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  29.74 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  29.74 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  24.38 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  35.51 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.49 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  22.34 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  23.39 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  36.22 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  36.22 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  35.82 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  24.87 
 
 		 336 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.7 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  31.29 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  23.65 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1100  hypothetical protein  27.91 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  22.97 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  21.51 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  23.94 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>