34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3631 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  94.41 
 
 		 143 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  88.81 
 
 		 143 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  65.73 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  42.75 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  41.61 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  40.13 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  38.81 
 
 		 236 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  39.86 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  36.5 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  32.58 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  36.91 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3619  hypothetical protein  31.71 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  33.06 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0765  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.86 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.510522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0511  peptidase M15A  41.27 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000425085  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  42.19 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30050  putative peptidoglycan-binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 246 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0031896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1443  Zinc D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.55 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3823  peptidase M15A  37.04 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  41.54 
 
 		 341 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0939  hypothetical protein  35.23 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.02091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1882  hypothetical protein  37.04 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0235  hypothetical protein  48.89 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0467  Peptidase M15A  31.71 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  30.89 
 
 		 513 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  41.51 
 
 		 347 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1742  Peptidase M15A  41.51 
 
 		 356 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000376247  normal  0.422133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1687  peptidase M15A  36.36 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000498215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  32.18 
 
 		 355 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  40.74 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2254  peptidase M15A  43.59 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  39.62 
 
 		 459 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1914  peptidase M15A  37.29 
 
 		 421 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0141502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>