More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0220 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
272 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  95.59 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  95.22 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  84.93 
 
 
272 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  80.74 
 
 
272 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  80.44 
 
 
272 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  73.43 
 
 
272 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  72.32 
 
 
273 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  61.25 
 
 
273 aa  345  5e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  61.48 
 
 
273 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  61.48 
 
 
273 aa  344  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  59.34 
 
 
334 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  61.03 
 
 
273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  57.35 
 
 
273 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  60.66 
 
 
273 aa  333  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  57.56 
 
 
273 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  56.62 
 
 
290 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  56.46 
 
 
273 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  56.09 
 
 
273 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  55.11 
 
 
274 aa  319  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 
274 aa  319  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  55.68 
 
 
273 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1149  alpha/beta hydrolase fold  55.22 
 
 
276 aa  315  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  56.46 
 
 
273 aa  315  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  54.98 
 
 
274 aa  315  7e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5030  Alpha/beta hydrolase fold  55.84 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  56.09 
 
 
273 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  53.48 
 
 
280 aa  311  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  54.41 
 
 
274 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  53.68 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  54.04 
 
 
273 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  54.34 
 
 
330 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 
277 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 
277 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  53.31 
 
 
277 aa  308  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  54.81 
 
 
322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 
273 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 
273 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  52.61 
 
 
322 aa  304  8.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  53.14 
 
 
273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  56.41 
 
 
277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  53.87 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  55.35 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
273 aa  300  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  53.11 
 
 
328 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  53.14 
 
 
340 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  52.19 
 
 
275 aa  298  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
338 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1992  non-heme chloroperoxidase  55.15 
 
 
273 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.707909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0603  non-heme chloroperoxidase  55.15 
 
 
273 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0694  non-heme chloroperoxidase  55.15 
 
 
273 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  52.26 
 
 
324 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  51.47 
 
 
324 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  50.74 
 
 
324 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
273 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  52.57 
 
 
273 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  49.63 
 
 
273 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  52.83 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  50.92 
 
 
275 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  48.71 
 
 
273 aa  285  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  50.56 
 
 
297 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1465  chloride peroxidase  52.4 
 
 
326 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6363  chloride peroxidase  52.4 
 
 
326 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.669549  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  49.82 
 
 
272 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2461  Alpha/beta hydrolase fold  48.52 
 
 
272 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7030  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 
326 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429028  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  50.37 
 
 
276 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2084  alpha/beta hydrolase fold protein  48.36 
 
 
275 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.446473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  50.74 
 
 
276 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  47.99 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  48.16 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  48.16 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  52.21 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  48.16 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 
278 aa  271  8.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  49.81 
 
 
279 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 
271 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 
276 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  48.53 
 
 
343 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  48.71 
 
 
273 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  49.08 
 
 
274 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  49.04 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  49.27 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  48.91 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  49.27 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  47.99 
 
 
274 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  47.81 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  48.91 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  47.81 
 
 
276 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  45.93 
 
 
292 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  48.66 
 
 
279 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 
274 aa  262  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  49.81 
 
 
290 aa  263  3e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  48.54 
 
 
277 aa  263  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  48.54 
 
 
276 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  46.89 
 
 
274 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2506  alpha/beta hydrolase fold protein  47.29 
 
 
278 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.505331  normal  0.76574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  56.22 
 
 
235 aa  260  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>