More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2544 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2544  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 295 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0054252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3403  Pirin domain protein  94.24 
 
 		 295 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.397774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2359  pirin domain-containing protein  92.54 
 
 		 295 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2453  pirin domain-containing protein  88.93 
 
 		 291 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1866  Pirin-like  67.94 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0300545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4260  Pirin-like protein  63.82 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2358  hypothetical protein  64.69 
 
 		 289 aa  391  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.241195  normal  0.454365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2105  pirin domain-containing protein  64.69 
 
 		 289 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2190  Pirin domain protein  65.73 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.859539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1995  pirin family protein  64.69 
 
 		 289 aa  391  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.758568  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1468  Pirin-like protein  64.34 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1471  Pirin-like  64.34 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1747  pirin family protein  65.73 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828927  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2153  pirin domain-containing protein  65.38 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.099247  normal  0.791413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0673  Pirin-like  66.08 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1034  pirin domain-containing protein  65.03 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683816  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1128  pirin domain-containing protein  66.08 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.645809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1030  pirin domain-containing protein  65.03 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.773031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1152  pirin domain-containing protein  66.08 
 
 		 288 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0560  hypothetical protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4686  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  62.94 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2877  hypothetical protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4264  Pirin-like protein  64.93 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1773  pirin family protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374691  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2450  hypothetical protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1000  pirin domain-containing protein  62.2 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2821  pirin domain-containing protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2762  pirin domain-containing protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2831  hypothetical protein  64.34 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0635165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4321  pirin domain-containing protein  64.56 
 
 		 303 aa  373  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1017  pirin protein  61.54 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1066  pirin protein  61.54 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4760  Pirin-like  62.89 
 
 		 293 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.189049 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0985  pirin protein  61.54 
 
 		 286 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3946  pirin domain-containing protein  63.64 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145016  normal  0.183598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1051  pirin protein  61.19 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.27273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0957  pirin domain protein  61.19 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.454428  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1537  Pirin domain protein  62.24 
 
 		 290 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.528503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0757  Pirin-like  62.59 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3984  pirin domain-containing protein  59.44 
 
 		 288 aa  358  6e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1780  Pirin-like protein  61.89 
 
 		 290 aa  358  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.286578  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2841  pirin family protein  63.25 
 
 		 286 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0616  pirin  60.41 
 
 		 293 aa  355  5.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2645  pirin-related protein  58.74 
 
 		 287 aa  348  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.808551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2562  Pirin domain protein  58.04 
 
 		 288 aa  344  1e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33430  putative pirin-related protein  61.13 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.158204  normal  0.0569236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2574  Pirin-like protein  53.71 
 
 		 286 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.408625 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3746  Pirin-like protein  50.17 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4059  Pirin domain protein  45.1 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0792  pirin family protein  44.29 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42930  predicted protein  43.09 
 
 		 311 aa  251  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5591  Pirin domain protein  46.69 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1938  pirin family protein  42.61 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6985  Pirin domain protein  42.34 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.16689  hitchhiker  0.00000014497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3676  Pirin domain protein  41.11 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  41.75 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0884  pirin domain-containing protein  42.91 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975363  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3538  Pirin domain protein  40.55 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  41.64 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  42.01 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  41.48 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  41.85 
 
 		 290 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  41.85 
 
 		 290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  41.11 
 
 		 290 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  42.22 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5875  Pirin-like  41.11 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  41.11 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  42.59 
 
 		 318 aa  185  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  40.81 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  40.37 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0624  Pirin domain protein  40.78 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00280  Pirin-related protein  35.74 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.239735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1048  Pirin-like  41.45 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0099  pirin domain-containing protein  39.64 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.854553  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5507  pirin domain-containing protein  40.49 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  41.18 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1948  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 		 346 aa  176  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  42.18 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7689  pirin domain-containing protein  34.77 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0677  hypothetical protein  34.87 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  38.83 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  39.31 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  39.21 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  39.37 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0441  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  41.91 
 
 		 348 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0074  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.416203  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0084  Pirin-like protein  37.41 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0093  pirin domain-containing protein  37.41 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28108  normal  0.0211992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  40.61 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  40.61 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  39.07 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  39.07 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0747  pirin domain-containing protein  38.57 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.989283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>