28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2705 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2705  TadE family protein  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  39.47 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  33.06 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  43.64 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  45.1 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  45.83 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  51.92 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  40.74 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3200  TadE family protein  28.95 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.798849 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  34.55 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  39.22 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  50 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  44.9 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  34.55 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  44.23 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  41.18 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  44 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  34.55 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  39.13 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  34.55 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1061  TadE family protein  32.76 
 
 		 166 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  45.1 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0607  TadE-like  40.35 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0129695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  43.14 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  36.73 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  32.73 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38.78 
 
 		 135 aa  40.8  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>