49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2557 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  100 
 
 		 485 aa  996    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  36.67 
 
 		 474 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  25.67 
 
 		 470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  24.94 
 
 		 473 aa  110  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  28.4 
 
 		 463 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  26.54 
 
 		 474 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  27.39 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  27.88 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  24.93 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  26.79 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  24.15 
 
 		 464 aa  93.6  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  27.84 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  23.45 
 
 		 461 aa  88.6  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  24.59 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  23.76 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  24.2 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  25.96 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  26.91 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  23.71 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  22.05 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  25.53 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  24.27 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  24.16 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  24.1 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  25.07 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  23.87 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  26.43 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  25.81 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  27.25 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  23.43 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  25.6 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  24.92 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  26.03 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  23.12 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  23.59 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  23.65 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  21.28 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  23.82 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  22.02 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  24.05 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  22.26 
 
 		 456 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8891  hypothetical protein  27.65 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  23.82 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  22.75 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  21.88 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  28.24 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  26.41 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  24.29 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  27.45 
 
 		 365 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>