35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0642 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  39.1 
 
 		 170 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  34.51 
 
 		 514 aa  115  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0643  hypothetical protein  40.62 
 
 		 165 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000647566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  47.5 
 
 		 497 aa  105  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  36.94 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  42.86 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 		 503 aa  98.2  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0521  hypothetical protein  37.25 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.82 
 
 		 538 aa  97.1  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  36.13 
 
 		 177 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  47.83 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0728  vir region protein-like protein  29.81 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  32.48 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  36.29 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  41.05 
 
 		 610 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0829  hypothetical protein  47.14 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833772  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  29.32 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  29.47 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  28.73 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  29.11 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0587  hypothetical protein  40.24 
 
 		 1097 aa  58.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  27.32 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2608  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  37.8 
 
 		 608 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3942  hypothetical protein  34.95 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191282  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1299  hypothetical protein  36.59 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  31.13 
 
 		 382 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  31.13 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2347  hypothetical protein  45.1 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  38.03 
 
 		 265 aa  46.2  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  38.03 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  36.05 
 
 		 587 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  38.04 
 
 		 591 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2373  hypothetical protein  28.93 
 
 		 210 aa  42  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0546821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>