29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0795 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0795  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1272    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2738  hypothetical flagellin  27.19 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177255  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07970  conserved hypothetical protein  24.25 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100095  normal  0.162889 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2685  hypothetical protein  34.32 
 
 
191 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1305  hypothetical protein  36.47 
 
 
199 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0682  vir region protein  33.54 
 
 
187 aa  63.9  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.246591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1250  hypothetical protein  32.55 
 
 
197 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.825022  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1375  pentapeptide repeat protein  43.02 
 
 
514 aa  60.5  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2652  vir region protein-like protein  30.67 
 
 
158 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1902  hypothetical protein  29.78 
 
 
197 aa  58.9  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06382  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
630 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199255  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2839  phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X region  29.92 
 
 
822 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1326  pentapeptide repeat-containing protein  40.23 
 
 
497 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1944  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0240  hypothetical protein  35.96 
 
 
170 aa  53.5  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.39733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1155  hypothetical protein  34.55 
 
 
610 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.135542  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0642  hypothetical protein  37.8 
 
 
227 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000875739  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2282  hypothetical protein  32.92 
 
 
191 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  37.93 
 
 
503 aa  52  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0083  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.03 
 
 
328 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0086  phosphatidylinositol diacylglycerol-lyase  27.03 
 
 
328 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0163  hypothetical protein  27.23 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0181  hypothetical protein  27.23 
 
 
265 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0771  vir region protein-like protein  35.63 
 
 
159 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
538 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1056  vir region protein-like protein  33.94 
 
 
208 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27067  predicted protein  25.5 
 
 
334 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336284  hitchhiker  0.0000242451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2281  hypothetical protein  43.1 
 
 
177 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48445  predicted protein  29.03 
 
 
489 aa  43.5  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>