More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0225 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  100 
 
 
154 aa  322  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2160  peptidoglycan-associated lipoprotein  75.97 
 
 
157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000805861  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0860  OmpA/MotB domain-containing protein  69.48 
 
 
152 aa  207  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.128552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0748  peptidoglycan-associated lipoprotein  63.64 
 
 
153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000605399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0615  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  65.58 
 
 
154 aa  191  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0124381  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1039  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  54.64 
 
 
183 aa  180  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.872127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0751  peptidoglycan-associated lipoprotein  54.84 
 
 
153 aa  157  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000145376  normal  0.0872971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0616  peptidoglycan-associated lipoprotein  61.9 
 
 
171 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0805483  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2159  peptidoglycan-associated lipoprotein  60.75 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00109799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0749  peptidoglycan-associated lipoprotein  56.07 
 
 
169 aa  137  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000395754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0861  OmpA/MotB domain-containing protein  57.14 
 
 
162 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0437517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0752  peptidoglycan-associated lipoprotein  55.14 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000800754  normal  0.153168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  56.19 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1710  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.4 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000475645  decreased coverage  0.0000694892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  60.58 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  40.67 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2123  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.83 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.089577  normal  0.358435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.4 
 
 
181 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  43.31 
 
 
170 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.91 
 
 
185 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1018  OmpA/MotB  54.46 
 
 
170 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.58 
 
 
199 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  52.34 
 
 
188 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4144  OmpA/MotB  39.33 
 
 
165 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  49.57 
 
 
193 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  40.69 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  50.45 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2132  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.46 
 
 
175 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250962  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 
167 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.87 
 
 
165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  50.48 
 
 
241 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3633  peptidoglycan-associated lipoprotein, putative  53.47 
 
 
177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  38.3 
 
 
194 aa  117  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  53.27 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.27 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  41.33 
 
 
166 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  53.92 
 
 
199 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3622  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.55 
 
 
177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.595111  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1695  Pal family lipoprotein  45.69 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1638  outer membrane lipoprotein Omp16 (minor outer membraneprotein omp16) (16 kDa OMP) (16.5 kDa minor OMP)  45.69 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0388  OmpA/MotB  51.46 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1220  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.83 
 
 
168 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.427658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2714  OmpA/MotB  45.13 
 
 
167 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3509  OmpA/MotB  35.53 
 
 
164 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.140214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0756  OmpA/MotB domain-containing protein  51.46 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.853822  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2593  peptidoglycan-associated lipoprotein  48.6 
 
 
176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000155055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2305  peptidoglycan-associated lipoprotein  51.96 
 
 
187 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.96 
 
 
170 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  47.41 
 
 
182 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1210  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.75 
 
 
158 aa  110  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240268  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0589  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.66 
 
 
179 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000303526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2415  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 
173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0687  OmpA domain-containing protein  40.12 
 
 
173 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.182199  normal  0.103402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4426  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.27 
 
 
185 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1095  OmpA/MotB  48.54 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0165  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.6 
 
 
174 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  50.98 
 
 
189 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  46.22 
 
 
182 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  46.22 
 
 
182 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  43.64 
 
 
166 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.64 
 
 
166 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3080  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.87 
 
 
164 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.430069  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3400  peptidoglycan-associated lipoprotein  46.02 
 
 
172 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.374002 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.64 
 
 
166 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3499  OmpA/MotB  50.47 
 
 
194 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.64 
 
 
165 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4332  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 
164 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0932864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.54 
 
 
169 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  45.54 
 
 
168 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.01 
 
 
170 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.93 
 
 
166 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.01 
 
 
170 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  43.93 
 
 
167 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1486  OmpA/MotB  45.45 
 
 
187 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00178508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 
199 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  42.73 
 
 
165 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  47.52 
 
 
190 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 
184 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  46.6 
 
 
179 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.55 
 
 
168 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3337  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.6 
 
 
242 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.54 
 
 
180 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.54 
 
 
163 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  33.54 
 
 
163 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  33.54 
 
 
163 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  47.06 
 
 
173 aa  100  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0857  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.66 
 
 
155 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000523751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2747  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 
177 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.57 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2537  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 
178 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000399266  hitchhiker  0.000124284 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003912  OmpA precursor  47.06 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0204489  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  43.56 
 
 
172 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5488  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.12 
 
 
172 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.429117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2730  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.1 
 
 
178 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000414349  hitchhiker  0.0000210242 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.16 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1743  peptidoglycan-associated lipoprotein  43.14 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000604821  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 
173 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>