More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1662 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 378 aa  788    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  42.67 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  42.13 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  41.51 
 
 		 383 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  41.35 
 
 		 385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  40.6 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  38.95 
 
 		 386 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 381 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  39.1 
 
 		 383 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  37.9 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  39.25 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  36.91 
 
 		 387 aa  262  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.97 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  35.34 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  36.27 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 395 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  32.35 
 
 		 375 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  34.9 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  34.9 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  33.07 
 
 		 383 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  34.64 
 
 		 393 aa  232  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  33.07 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  33.84 
 
 		 405 aa  226  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  33.07 
 
 		 383 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  32.46 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  32.28 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  32.02 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.9 
 
 		 389 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.5 
 
 		 383 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  31.61 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  34.7 
 
 		 395 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  32.02 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 521 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  30.15 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  30.41 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  29.64 
 
 		 390 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  33.08 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  31.58 
 
 		 386 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  31.46 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  30.53 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  30.62 
 
 		 372 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  28.87 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  31.11 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  31.19 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  27.88 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  30 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  31.01 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  30.95 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  29.63 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  32.47 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  33.16 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  29.49 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  30.05 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  30.05 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  34.76 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  30.21 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  32.3 
 
 		 390 aa  192  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.43 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 		 397 aa  190  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  31.44 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  31.41 
 
 		 390 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  32.2 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  32.2 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.38 
 
 		 387 aa  187  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  30.93 
 
 		 391 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  31.52 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  30.57 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  30.81 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  30.81 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  30.81 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  30.81 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  30.55 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  30.55 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  30.55 
 
 		 390 aa  176  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  29.13 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  30.36 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 		 514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.29 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  29.52 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  29.5 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.1 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.1 
 
 		 392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  29.95 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  27.89 
 
 		 389 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>