294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0014 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  59.92 
 
 
252 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  59.76 
 
 
252 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  59.76 
 
 
252 aa  275  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  65.13 
 
 
253 aa  254  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  59.24 
 
 
252 aa  251  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  52.44 
 
 
252 aa  238  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  52.48 
 
 
252 aa  236  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  52.07 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  53.72 
 
 
252 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  47.98 
 
 
252 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  48.97 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  48.39 
 
 
252 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  48.39 
 
 
252 aa  221  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  48.4 
 
 
256 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  48.95 
 
 
253 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  48.95 
 
 
276 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  48.54 
 
 
253 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  48.39 
 
 
252 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  50.41 
 
 
252 aa  205  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  48.97 
 
 
259 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  48.54 
 
 
253 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  40.57 
 
 
254 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  42.45 
 
 
254 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  40.98 
 
 
264 aa  175  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  38.43 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  43.22 
 
 
260 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  40.82 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  41.18 
 
 
286 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  40 
 
 
262 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  40.47 
 
 
272 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  44.69 
 
 
254 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  40.32 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  43.93 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  37.05 
 
 
251 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  37.05 
 
 
251 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  37.05 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  37.3 
 
 
256 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  37.4 
 
 
270 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  37.3 
 
 
256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  37.75 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  38.24 
 
 
269 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  37.96 
 
 
269 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  37.96 
 
 
269 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  37.96 
 
 
269 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  37.96 
 
 
269 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  37.3 
 
 
256 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  35.97 
 
 
257 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  38.93 
 
 
255 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  36.76 
 
 
250 aa  159  5e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  38.93 
 
 
255 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 
258 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  37.55 
 
 
254 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  38.93 
 
 
255 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  36.47 
 
 
257 aa  158  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  41.9 
 
 
267 aa  157  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  36.14 
 
 
254 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  35.69 
 
 
253 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  36.99 
 
 
251 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  36.14 
 
 
254 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  34.15 
 
 
266 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  38.43 
 
 
272 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  35.97 
 
 
254 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  36.14 
 
 
254 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  36.51 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
267 aa  155  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  36.48 
 
 
268 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  40.62 
 
 
254 aa  154  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  36.48 
 
 
268 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  38.66 
 
 
269 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  36.48 
 
 
268 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  38.24 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  38.24 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  36.08 
 
 
253 aa  152  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  38.53 
 
 
279 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  37.5 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  38.93 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  36.1 
 
 
266 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  35.41 
 
 
259 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>