27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2621 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2621  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2737  3'-5' exonuclease  78.17 
 
 		 198 aa  330  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2827  3'-5' exonuclease  63.64 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0393048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1697  3'-5' exonuclease  55.26 
 
 		 203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4830  3'-5' exonuclease  44.15 
 
 		 294 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0991293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2470  3'-5' exonuclease  41.58 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.774502  normal  0.494629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1397  3'-5' exonuclease  37.57 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937954  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2929  3'-5' exonuclease  31.38 
 
 		 298 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00209751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1153  exonuclease, putative  34.97 
 
 		 261 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0976  3'-5' exonuclease  35.62 
 
 		 299 aa  91.3  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0707907 
 
 
-
 
NC_002950  PG0365  3'-5' exonuclease domain-containing protein  32.54 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0883  3'-5' exonuclease  33.14 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0280341 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1014  3'-5' exonuclease  35 
 
 		 303 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0888  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 238 aa  88.2  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.329161  normal  0.376556 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3433  3'-5' exonuclease  29.89 
 
 		 292 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1912  3'-5' exonuclease  32.8 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254298  normal  0.272354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3291  3'-5' exonuclease  32.45 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000349721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1066  3'-5' exonuclease  31.46 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0869717  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0980  3'-5' exonuclease  34.48 
 
 		 303 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3387  3'-5' exonuclease  34.57 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3512  3'-5' exonuclease  31.46 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.643646  normal  0.0140367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1964  3'-5' exonuclease  34.46 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2388  3'-5' exonuclease  28.16 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000109184  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27893  predicted protein  28.67 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.70309 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93442  predicted protein  26.92 
 
 		 389 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46734  predicted protein  28.48 
 
 		 894 aa  52.4  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  27.5 
 
 		 383 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>